من الناحية الهيكلية، تتميز مركبات السيلوكسان العضوية المتعددة بالخصائص التالية:
(1) السلسلة الرئيسية لروابط Si-O-Si غير عضوية، في حين أن السلاسل الجانبية عبارة عن مجموعات عضوية، مما يجعلها بوليمر شبه عضوي نموذجي شبه-غير عضوي وشبه-.
(2) زاوية الرابطة (∠SiOSi) لروابط Si-O-Si في السلسلة الرئيسية هي 130 درجة -145 درجة، وطول رابطة روابط Si-O هو 0.163 نانومتر-0.164 نانومتر، وطاقة الرابطة 367.8 كيلوجول/مول. بالمقارنة مع أكاسيد الكربون في نفس المجموعة (زاوية الرابطة ∠COC 108 درجة، C-O طول الرابطة 0.142 نانومتر، طاقة الرابطة 357.4 كيلو جول/مول)، فإن البولي سيلوكسانات لها زاوية رابطة كبيرة، وطول رابطة طويل، وطاقة رابطة عالية في سلسلتها الرئيسية.
(3) زاوية الرابطة C-Si-O في السلسلة الجانبية هي 160 درجة، وطول الرابطة C-Si هو 0.188 نانومتر. لذلك، فإن طاقة التنشيط اللازمة لمجموعة الميثيل في السلسلة الجانبية لتدور حول رابطة Si-O منخفضة، فقط 8 كيلوجول/مول.
(4) التفاعلات ثنائية القطب - ثنائية القطب بين روابط Si-O في العمود الفقري للبولي سيلوكسان والتفاعلات بين مجموعات Si - CH3 في السلاسل الجانبية تتسبب في وجود جزيء البولي سيلوكسان في بنية حلزونية معينة - بحيث تكون مجموعة الميثيل متجهة إلى الخارج ورابطة الأكسجين - السيليكون متجهة إلى الداخل. يؤدي هذا الهيكل الفريد إلى تفاعلات ضعيفة بين السلاسل-، وحجم مولي كبير، وتوتر سطحي منخفض في البولي سيلوكسان.
(5) مركبات البولي سيلوكسان التي تحتوي على مجموعات Si-H، أو Si-OR، أو Si-OH كمجموعات جانبية كلها تفاعلية.
